2022-04-19 08:49来源:m.sf1369.com作者:宇宇
如果有标准曲线,按照标准曲线计算。一般都是相对量。则用delta delta CT方法来计算。举例如下:对照组基因A的CT值为20, 内参(比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18,内参CT值14。首先算加样量:delta CT=15-14=1。2的1次方是2。也就是说实验组的加样量是对照组的2倍。基因A: delta CT=20-18=2。2的2次方是4。也就是说基因A的量在实验组是对照组的4倍。但是由于加样量是2倍,所以4处以2=2,最后的相对量是2倍。几点注意: 1。必须确定扩增的特异性 2。 只有相同目标的CT值才能相减(扩增效率有可能不同) 3。 2的某次方只是理论值,实际扩增效率低于2。 4。 最好不用Syber Green
实时荧光定量PCR技术是在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。基线在PCR扩增反应的最初数个循环里,荧光信号变化不大,接近一条直线,这样的直线即基线。光域值threshold的设定,一般将PCR反应前15个循环的荧光信号作为荧光本底信号,荧光域值是PCR3-15个循环荧光信号标准差的10倍,荧光域值设定在PCR扩增的指数期。CT值表示每个PCR反应管内荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数。研究表明,各模板的CT值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系,起始拷贝数越多,CT值越小,反之亦然。融解曲线是用来验证扩增产物特异性的,如果产物是单一条带,融解曲线就会出现一尖峰;如果有引物二聚体或其它非特异性扩增,就会出现至少两个尖峰。扩展资料:时荧光定量PCR仪Real-TimeqPCR常见问题分析:1、无Ct值出现1)检测荧光信号的步骤有误:一般SG法采用72℃延伸时采集,Taqman法。则一般在退火结束时或延伸结束采集信号;2)引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性;3)模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;4)模板降解:避免样品制备中杂质的引入及反复冻融的情况。2、Ct值出现过晚(Ct>38)1)扩增效率低:反应条件不够优化,设计更好的引物或探针、改用三步法进行反应、适当降低退火温度、增加镁离子浓度等;2)PCR各种反应成分的降解或加样量不足,3)PCR产物太长:一般采用80-150bp的产物长度。3、标准曲线线性关系不佳1)加样存在误差:使得标准品不呈梯度;2)标准品出现降解:应避免标准品反复冻融,或重新制备并稀释标准品;3)引物或探针不佳:重新设计更好的引物和探针;4)模板中存在抑制物,或模板浓度过高。参考资料来源:中国知网—实时荧光定量PCR的数据分析方法参考资料来源:百度百科—实时荧光定量PCR