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实时定量PCR的结果是怎样分析的

2022-04-06 22:53来源:m.sf1369.com作者:宇宇

1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算。

2、一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算。

3、举例如下:对照组基因A的CT值为20, 内参(比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18,内参CT值14。

4、首先算加样量:delta CT=15-14=1。2的1次方是2。也就是说实验组的加样量是对照组的2倍。基因A: delta CT=20-18=2。2的2次方是4。也就是说基因A的量在实验组是对照组的4倍。但是由于加样量是2倍,所以4处以2=2,最后的相对量是2倍。

5、几点注意:必须确定扩增的特异性,只有相同目标的CT值才能相减(扩增效率有可能不同),2的某次方只是理论值,实际扩增效率低于2,最好不用Syber Green。

扩展资料:

PCR原理:

1、PCR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。

2、PCR由变性-退火-延伸三个基本反应步骤构成:

①模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备;

②模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;

③引物的延伸:DNA模板-引物结合物在72℃、DNA聚合酶(如TaqDNA聚合酶)的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基互补配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA链互补的半保留复制链。每完成一个循环需2~4分钟,2~3小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。

参考资料来源:百度百科--PCR反应

如果有标准曲线,按照标准曲线计算。一般都是相对量。则用delta delta CT方法来计算。举例如下:

对照组基因A的CT值为20, 内参(比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18,内参CT值14。

首先算加样量:delta CT=15-14=1。2的1次方是2。也就是说实验组的加样量是对照组的2倍。

基因A: delta CT=20-18=2。2的2次方是4。也就是说基因A的量在实验组是对照组的4倍。但是由于加样量是2倍,所以4处以2=2,最后的相对量是2倍。

注意:1、必须确定扩增的特异性

2、 只有相同目标的CT值才能相减(扩增效率有可能不同)

3、 2的某次方只是理论值,实际扩增效率低于2

4、 最好不用Syber Green

扩展资料

实时荧光定量PCR由于荧光物质的应用,可以通过光电传导系统直接探测PCR扩增过程中荧光信号的变化以获得定量结果,克服了常规PCR的许多缺点,具有如下优势:

①能对模板定量;

②封闭反应,无需PCR后处理,污染少,假阳性率低;

③观察和记录自动化,结果直观,避免人为判断带来的误差;

④工作效率高,利于实现高通量检测。

实时荧光定量PR的缺点表现:

①需要特殊设备以及荧光探针,成本较高;

②不能显示PCR产物的片段长度;

③定量准确性还有待提高。

参考资料来源:百度百科-定量PCR

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